Olimpiada de Biología - Departamento de Biología Molecular

El Departamento de Biología Molecular http://departamentos.unican.es/biomol/ (Tel. 942 20 19 46) se ocupa de la organización de la fase local de la IV Olimpiada de Biología dirigida a estudiantes de Bachillerato.

http://www.olimpiadadebiologia.edu.es/

Biotechnology Journal 2008: Changing the recognition site of a conjugative relaxase by rational design

Blanca González-Pérez, José Daniel Carballeira, Gabriel Moncalián, Fernando de la Cruz.
Abstract
TrwC is a relaxase protein, which starts and finishes DNA processing during bacterial conjugation in plasmid R388. TrwC recognizes a specific sequence of DNA (25 nucleotides) in the donor cell: the nic-site. As a model example, a single transversion C24G in nic avoids DNA processing by TrwC. Using this simple model, our objective was to obtain a proof of principle that TrwC specificity can be changed. Several structures of DNA-TrwC complexes were used as reference to design a focused saturation mutagenesis library (NNK) randomizing amino acid Lys262, since its side chain seems to sterically hinder the recognition of the C24G nic mutation by wild-type TrwC. Using bacterial conjugation as an in vivo selection system, several TrwC variants were found that show changes in substrate specificity. These variants were also tested in a competitive assay to evaluate their conjugation efficiency.

http://dx.doi.org/10.1002/biot.200800184

Un investigador de la UC publica en 'Cell'

Un investigador del Instituto de Biomedicina y Biotecnología (IBBTEC) de la Universidad de Cantabria (UC) ha publicado en la revista científica 'Cell' -la más prestigiosa del mundo en el campo de la biomedicina- un trabajo que aporta nuevos detalles sobre la reparación del ADN, un proceso que resulta fundamental para la supervivencia de las células. Gabriel Moncalián Montes, investigador del programa 'Ramón y Cajal', y los otros trece coautores del descubrimiento describen en su artículo la forma en la que una proteína llamada Mre11 actúa en el proceso de reparación de las moléculas de ADN. El trabajo (cuyo título original es 'Mre11 Dimers Coordinate DNA End Bridging and Nuclease Processing in Double-Strand-Break Repair') explica que la Mre11 se convierte en una proteína compuesta por dos unidades, y que con esa estructura doble la proteína replica los trozos de ADN para restaurar la cadena. Moncalián lidera el subgrupo de investigación 'Ingeniería de Proteínas' del IBBTEC, del que forman parte Yera Tena, Juan Villa, Blanca González y Matilde Cabezas.

http://www.eldiariomontanes.es/20081005/cantabria/noticias/investigador-publica-cell-20081005.html

Cell 2008: Mre11 Dimers Coordinate DNA End Bridging and Nuclease Processing in Double-Strand-Break Repair .

R . Williams* , G . Moncalian* , J . Williams , Y . Yamada , O . Limbo , D . Shin , L . Groocock , D . Cahill , C . Hitomi , G . Guenther. (* these authors contribute equally)

Mre11 forms the core of the multifunctional Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex that detects DNA double-strand breaks (DSBs), activates the ATM checkpoint kinase, and initiates homologous recombination (HR) repair of DSBs. To define the roles of Mre11 in both DNA bridging and nucleolytic processing during initiation of DSB repair, we combined small-angle X-ray scattering (SAXS) and crystal structures of Pyrococcus furiosus Mre11 dimers bound to DNA with mutational analyses of fission yeast Mre11. The Mre11 dimer adopts a four-lobed U-shaped structure that is critical for proper MRN complex assembly and for binding and aligning DNA ends. Further, mutations blocking Mre11 endonuclease activity impair cell survival after DSB induction without compromising MRN complex assembly or Mre11-dependant recruitment of Ctp1, an HR factor, to DSBs. These results show how Mre11 dimerization and nuclease activities initiate repair of DSBs and collapsed replication forks, as well as provide a molecular foundation for understanding cancer-causing Mre11 mutations in ataxia telangiectasia-like disorder (ATLD). http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2008.08.017

Diario Médico

Europa press

Journal Bacteriology, 2008 ATPase activity and oligomeric state of TrwK, the VirB4 homologue of plasmid R388 Type IV secretion system.

Ignacio Arechaga, Alejandro Peña, Sandra Zunzunegui, María del Carmen Fernández-Alonso, Germán Rivas and Fernando de la Cruz.

Type IV secretion systems (T4SS) mediate the transfer of DNA and protein substrates to target cells. TrwK, encoded by the conjugative plasmid R388, is a member of the VirB4 family, the largest and most conserved protein of T4SS. VirB4 was suggested to be an ATPase involved in energizing pilus assembly and substrate transport. However, conflicting experimental evidence concerning VirB4 ATP hydrolase activity was reported. Here, we demonstrate that TrwK is able to hydrolyze ATP in vitro in the absence of its potential macromolecular substrates and other T4SS components. The kinetic parameters of its ATPase activity have been characterized. TrwK oligomerization state was investigated by analytical ultracentrifugation and electron microscopy, and its effects on the ATPase activity were analyzed. The results suggest that the hexameric form of TrwK is the catalytically active state, much like the structurally related protein TrwB, the conjugative coupling protein. http://dx.doi.org/10.1128/JB.00321-08

Convocado 2º Master en Biología Molecular de la Facultad de Medicina de la Universidad de Cantabria

La Universidad de Cantabria lanza ahora una nueva edición del Máster en Biología Molecular, que ha contado ya con una primera promoción de 13 licenciados en diferentes ramas biosanitarias que en breve se van a incorporar a grupos de investigación. Está experiencia se lleva a cabo con la intención de impartir en el futuro el Grado de Biotecnología .El Máster Oficial de Posgrado en Biología Molecular y Biomedicina (MBMB) cuenta con la participación de los tres departamentos de Ciencias Básicas de la Facultad de Medicina y tiene carácter interuniversitario, al impartirse conjuntamente con departamentos de la Universidad del País Vasco. En la primera edición se ha impartido un programa de formación teórico-práctico intensivo que les ha abierto la posibilidad de incorporarse como doctorandos en distintos grupos de investigación de la Facultad de Medicina y del Hospital Marqués de Valdecilla. Estos grupos trabajan en áreas tan dispares como la inmunidad, las infecciones, la genética, el cáncer, las neurociencias, las enfermedades cardiovasculares o la embriología.De cara al próximo curso, del 7 al 11 de julio ha estado abierto en la UC un primer plazo para la preinscripción al máster de nuevos alumnos. El segundo plazo estará disponible del 21 al 24 de septiembre. El coordinador del master, el inmunólogo Jesús Merino, del departamento de Biología Molecular, está «satisfecho» con los resultados del máster que ahora entra en su segunda edición.

http://www.eldiariomontanes.es/20080713/cantabria/convocado-segundo-master-biologia-20080713.html

Master en Biología Molecular y Biomedicina - Universidad de Cantabria & Universidad del País Vasco

Master de acceso a un doctorado distinguido con la mención de calidad por el Ministerio de Educación y Ciencia para el curso académico 2008-2009

Desde la revolucionaria propuesta de Watson y Crick, en 1953, sobre la estructura en doble helicoide del DNA, la biología molecular no ha dejado de crecer y desarrollarse, hasta “invadir” las regiones más activas de la biología y la medicina. Así la bioquímica, la genética, la fisiología, la biología celular, las neurociencias, y tantas otras ramas de la investigación biomédica, han entrado en el torbellino de la biología molecular, torbellino positivo, que arrastra en su espiral ascendente a multitud de disciplinas multiplicando su utilidad y sus resultados. Poco más de medio siglo después del descubrimiento inicial, hoy es muy difícil hacer biología sin hacer biología molecular.
El Master en Biología Molecular y Biomedicina (MBMB) agrupa a la práctica totalidad de los investigadores de la UPV/EHU activos en las áreas de la Biología Molecular y Genética, y en los aspectos moleculares de la Biomedicina. Lo mismo se aplica al ciclo pre-clínico de la Facultad de Medicina de la Universidad de Cantabria. También participan numerosos investigadores de CIC-bioGUNE y sus empresas asociadas. Esto supone un total de al menos 36 grupos de gran actividad, que en el último trienio totalizan más de 70 proyectos de investigación de financiación externa, y más de 400 artículos de investigación.
Por otra parte, es de todos conocido que la I+D+i del sector profesional asociado a la Biología Molecular y la Biomedicina tiene una vitalidad sin parangón en ninguna otra actividad. Baste señalar que, en este sector, se da con frecuencia la transferencia directa de conocimientos de la investigación básica a la explotación comercial.
Al ofrecer el MBMB a los graduados de las más variadas disciplinas, unidos por un interés común en la Biología Molecular, estamos seguros de contribuir de manera eficiente, con una formación de calidad, al desarrollo de una nueva generación de profesionales de la investigación, el desarrollo y la innovación.
Documento con información sobre el Máster Biología Molecular y Biomedicina.(pdf,36KB)

Más información

http://www.masterbiologiamolecular.ehu.es/p102-1001/es/contenidos/informacion/biologia_molecular/es_bmybm204/presentacion.html

MSc in Molecular Biology & Biomedicine

Master for gaining admittance to a Ph.D. programme awarded Distinction of Quality by the Spanish Ministry of Education and Science 2008-2009 academic year.

Introduction


Ever since the revolutionary postulate on the double helical structure of DNA was advanced by Watson and Crick in 1953, molecular biology has not ceased to grow and develop; it has even “invaded” the most active spheres of biology and medicine. Thus, biochemistry, genetics, physiology, cellular biology, the neurosciences, and many other branches of biomedical research have entered the whirlwind of molecular biology, a positive whirlwind that pulls into its ascending spiral a multitude of disciplines, and multiplies their usefulness and results. Little over half a century since its initial discovery, it is very difficult to do biology nowadays without doing molecular biology.
The Master’s in Molecular Biology & Biomedicine (MBBM) gathers together virtually all the researchers of the UPV/EHU who are active in the areas of Molecular Biology and Genetics, and in the molecular aspects of Biomedicine. The same is applicable in the preclinical cycle of the Faculty of Medicine at the University of Cantabria. Many researchers from CIC-bioGUNE and the companies associated with it also participate. This signifies a total of at least 36 highly active groups, who in the last three-year period total over 70 research projects with external funding, and over 400 research papers.
Furthermore, it is a well-known fact that that R+D+Innovation in the professional sector associated with Molecular Biology & Biomedicine has an incomparable vitality not found in any other activity. It suffices to say that in this sector knowledge about basic research is frequently transferred directly to commercial exploitation.
We are convinced that by offering the MBBM to graduates from the most varied of disciplines, united by a shared interest in Molecular Biology, we are contributing effectively through quality training to the development of a new generation of professionals in research, development and innovation.
Document with information on the MSc. Molecular Biology and Biomedicine.(pdf,36KB)





More information


http://www.masterbiologiamolecular.ehu.es/p102-1000/en

REIPI - Red Española de Investigación en Patología Infecciosa

La Red Española de Investigación en Patología Infecciosa (REIPI) es un espacio de investigación interterritorial encuadrado dentro de la las Redes Temáticas de Investigación Cooperativa en Salud (RETICS), a través del "Instituto de Salud Carlos III", Ministerio de Ciencia e Innovación, en el que participan veinticinco grupos de investigación de siete comunidades autónomas, procedentes del Sistema Sanitario, de la Universidad y del Consejo Superior de Investigaciones Científicas.

Los grupos que la constituyen tienen como objetivo producir conocimiento científico en el área de las enfermedades infecciosas, agrupando a microbiólogos, infectólogos e inmunólogos, vinculados a grupos de investigación básica, traslacional y clínico-epidemiológica.

Las áreas de trabajo de la REIPI son diversas, al incluir sus grupos de investigación, especialmente aquellos procedentes del Sistema Sanitario, a un número importante de investigadores. Así, la REIPI se ocupa de investigación en antimicrobianos y resistencias microbianas, de infecciones comunitarias y hospitalarias, de infecciones en pacientes inmunodeprimidos, y de las bases moleculares de la patogenia, el diagnóstico y el tratamiento de las infecciones. Por otra parte, dado que el conocimiento producido tiene como vocación su traslación en último término a los pacientes, los objetivos estratégicos principales están agrupados en trece Problemas de Salud, definidos por el Comité Científico de la Red.

http://www.reipi.org/