Wednesday, May 30, 2007

IBBTEC - Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria

Presentado el IBBTEC

La Universidad de Cantabria, el Gobierno regional y el CSIC han puesto en marcha el nuevo centro de excelencia, presentado hoy en Santander


El Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria (IBBTEC) comenzará a funcionar en la Facultad de Medicina de la Universidad de Cantabria a través de once grupos de I+D+i seleccionados para el proyecto y con un presupuesto inicial de 13 millones de euros. Esta cantidad se destinará a equipamiento científico y a la construcción de la futura sede del IBBTEC, que se ubicará en el Parque Científico y Tecnológico de Cantabria (PCTCAN) y que previsiblemente estará finalizada en la primavera-verano de 2009.
El proyecto científico del instituto fue presentado hoy en Santander, en una jornada que contó con la asistencia del rector de la UC, Federico Gutiérrez-Solana, el vicerrector de Investigación y Desarrollo y presidente de la Comisión Rectora del IBBTEC, José Carlos Gómez Sal, el director general de Universidades e Investigación del Ejecutivo regional, Andrés Hoyo, el coordinador científico y técnico del Área de Biología y Biomedicina del CSIC, Andrés Aguilera López, el decano de la Facultad de Medicina, Francisco Javier Llorca, y el director del nuevo Instituto, el catedrático Ángel Pazos.
Federico Gutiérrez-Solana destacó la importancia de este proyecto estratégico para la comunidad cántabra, que “aúna la capacidad de las tres instituciones” -UC, CSIC y Gobierno de Cantabria-. Según el rector, las entidades fundadoras esperan que el IBBTEC sea “un motor de desarrollo y foco que haga ver la capacidad de Cantabria en una empresa de futuro tan importante como es la de gestionar el conocimiento”.
Previamente al acto de presentación tuvo lugar la primera reunión de la Comisión Rectora del Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria, que designó a los miembros de la Comisión Gestora y al catedrático Ángel Pazos como director de la entidad. Pazos explicó que contar con un centro de excelencia como el IBBTEC reportará beneficios “a todo el tejido económico de Cantabria”. Algunos de los sectores que verán esa influencia son la ganadería, con el desarrollo de nuevas vacunas para infecciones persistentes, y la alimentación, ya que se podrán realizar test de laboratorio que sirvan en toxicología.
En definitiva, la nueva entidad investigadora permite desarrollar “áreas en las que Cantabria ya era potente y atender a necesidades futuras”, señaló el director del Instituto, cuyos once grupos, seleccionados por una comisión internacional externa a la Universidad de Cantabria, están integrados por científicos de la misma y de cinco organismos pertenecientes al CSIC. Los equipos trabajarán en cinco áreas de la investigación básica y aplicada: Señalización Molecular en Oncología e Inmunología; Neurobiología; Biología del Desarrollo; Microbiología Molecular; y Genómica y Biocomputación. Además, el instituto contará con una Unidad de Diagnóstico y Evaluación Biológica.
INVESTIGACIÓN DE CALIDAD

El IBBTEC nace con el objetivo de convertirse en centro de referencia en su área y en foco de atracción para empresas de base biológica, especialmente las de los sectores farmacéutico y agroalimentario. Para ello procurará que la investigación básica se plasme en patentes y en transferencia tecnológica hacia el sector productivo, un reto que “marcará un antes y un después”, señala Ángel Pazos.
Cuando está asentado, el proyecto contará con una veintena de grupos de I+D+i en los que trabajarán alrededor de 200 personas entre científicos, técnicos y administradores. Las instalaciones del Instituto en el PCTCAN, a tres kilómetros de la ciudad de Santander, tendrán una superficie aproximada de 6.500 m2 y contarán con los servicios de apoyo y equipamientos adecuados para la investigación biológica.
Grupos de I+D+i seleccionados para el IBBTEC

Área: Señalización Molecular en Oncología

Grupo 1.

Responsable: Piero Crespo

Entidad de procedencia: Instituto de Investigaciones Biomédicas (IIB), Madrid (CSIC, en unidad asociada a la UC)
Grupo 2.

Responsable: Javier León

Entidad de procedencia: Universidad de Cantabria

Grupo 3.

Responsable: Atanasio Pandiella

Entidad de procedencia: Centro de Investigación en Cáncer, Salamanca (CSIC)
Área: Señalización Molecular e Inmunología

Grupo 4.

Responsable: Ramón Merino

Entidad de procedencia: Centro de Investigaciones Biológicas (CIB), Madrid (CSIC, en unidad asociada a la UC)
Área: Neurobiología

Grupo 5.

Responsable: Ángel Pazos

Entidad de procedencia: Universidad de Cantabria
Área: Biología del Desarrollo

Grupo 6.

Responsable: Isabel Guerrero

Entidad de procedencia: Centro de Biología Molecular (CBM), Madrid (CSIC)
Grupo 7.

Responsable: Mª Ángeles Ros

Entidad de procedencia: Instituto de Biología y Genética Molecular (IBGM), Valladolid (CSIC)

Área: Microbiología Molecular

Grupo 8.

Responsable: Matxalen Llosa

Entidad de procedencia: Universidad de Cantabria
Grupo 9.

Responsable: Wilfried Meijer

Entidad de procedencia: Centro de Biología Molecular (CBM), Madrid (CSIC)
Grupo 10.

Responsable: Juan M. García Lobo

Entidad de procedencia: Universidad de Cantabria

Área: Genómica

Grupo 11.

Responsable: Fernando de la Cruz

Intergenomics Group. Fernando de la Cruz Lab http://grupos.unican.es/intergenomica/

Entidad de procedencia: Universidad de Cantabria

Unidad de Diagnóstico y Evaluación Biológica

Responsable: Sin designar.

http://www.unican.es/WebUC/Internet/Noticias_y_novedades/historico/2007/2trimestre/20070530+a.htm

Tuesday, May 15, 2007

Analysis of DNA processing reactions in bacterial conjugation by using suicide oligonucleotides. The EMBO Journal

Blanca Gonzalez-Perez, María Lucas, Leonie A Cooke, Joseph S Vyle, Fernando de la Cruz and Gabriel Moncalián
Departamento de Biología Molecular (Universidad de Cantabria) and Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria (CSIC-UC-IDICAN), Santander, Spain2 School of Chemistry and Chemical Engineering, The Queen's University of Belfast, Belfast, UKTo whom correspondence should be addressedFernando de la Cruz, Departamento de Biologia Molecular, Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria (CSIC), Universidad de Cantabria, Cardenal Herrera Oria s/n, Santander 39011, Spain. Tel.: +34 94 2201 942; Fax: +34 94 2201 945; E-mail: delacruz@unican.es Received 9 March 2007; Accepted 26 June 2007; Published online 26 July 2007.
Abstract
Protein TrwC is the conjugative relaxase responsible for DNA processing in plasmid R388 bacterial conjugation. TrwC has two catalytic tyrosines, Y18 and Y26, both able to carry out cleavage reactions using unmodified oligonucleotide substrates. Suicide substrates containing a 3'-S-phosphorothiolate linkage at the cleavage site displaced TrwC reaction towards covalent adducts and thereby enabled intermediate steps in relaxase reactions to be investigated. Two distinct covalent TrwC–oligonucleotide complexes could be separated from noncovalently bound protein by SDS–PAGE. As observed by mass spectrometry, one complex contained a single, cleaved oligonucleotide bound to Y18, whereas the other contained two cleaved oligonucleotides, bound to Y18 and Y26. Analysis of the cleavage reaction using suicide substrates and Y18F or Y26F mutants showed that efficient Y26 cleavage only occurs after Y18 cleavage. Strand-transfer reactions carried out with the isolated Y18–DNA complex allowed the assignment of specific roles to each tyrosine. Thus, only Y18 was used for initiation. Y26 was specifically used in the second transesterification that leads to strand transfer, thus catalyzing the termination reaction that occurs in the recipient cell.
Keywords: 3'-S-phosphorothiolate-containing oligonucleotides, bacterial conjugation, relaxase, transesterification